Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SETD3Q86TU7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD3Q86TU7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD3Q86TU7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD3Q86TU7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD3Q86TU7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD3Q86TU7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD3Q86TU7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD3Q86TU7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD3Q86TU7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD3Q86TU7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD3Q86TU7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD3Q86TU7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD3Q86TU7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD3Q86TU7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms