Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATG9AQ7Z3C6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATG9AQ7Z3C6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATG9AQ7Z3C6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms