Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NLRC3Q7RTR2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NLRC3Q7RTR2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms