Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CCDC141Q6ZP82 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CCDC141Q6ZP82 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC141Q6ZP82 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC141Q6ZP82 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms