Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TPTE2Q6XPS3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TPTE2Q6XPS3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TPTE2Q6XPS3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms