Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEACAM20Q6UY09 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CEACAM20Q6UY09 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CEACAM20Q6UY09 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms