Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO38Q6PIJ6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO38Q6PIJ6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO38Q6PIJ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO38Q6PIJ6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO38Q6PIJ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO38Q6PIJ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO38Q6PIJ6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO38Q6PIJ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO38Q6PIJ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO38Q6PIJ6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO38Q6PIJ6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO38Q6PIJ6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO38Q6PIJ6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms