Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NANOGP8Q6NSW7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NANOGP8Q6NSW7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms