Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CARMIL1Q5VZK9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CARMIL1Q5VZK9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms