Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACHD1Q5VU97 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACHD1Q5VU97 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms