Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIF1Q5T3J3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRIF1Q5T3J3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIF1Q5T3J3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms