Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQS7

SH2D4B, SH2 domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4BQ5SQS7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH2D4BQ5SQS7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH2D4BQ5SQS7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms