Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL4Q5MAI5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKL4Q5MAI5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms