Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TCTE1Q5JU00 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCTE1Q5JU00 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCTE1Q5JU00 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms