Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CT47A1Q5JQC4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CT47A1Q5JQC4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms