Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9I0

TFDP3, Transcription factor Dp family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP3Q5H9I0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFDP3Q5H9I0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFDP3Q5H9I0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFDP3Q5H9I0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms