Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL12Q53G59 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL12Q53G59 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms