Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BBS9Q3SYG4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BBS9Q3SYG4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBS9Q3SYG4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms