Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SP6Q3SY56 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SP6Q3SY56 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SP6Q3SY56 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms