Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms