Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSR1Q2NL82 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSR1Q2NL82 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSR1Q2NL82 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms