Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CSPP1Q1MSJ5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPP1Q1MSJ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms