Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP1R3AQ16821 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3AQ16821 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1R3AQ16821 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1R3AQ16821 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1R3AQ16821 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1R3AQ16821 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1R3AQ16821 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1R3AQ16821 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1R3AQ16821 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1R3AQ16821 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1R3AQ16821 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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