Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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KCNMB1Q16558 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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KCNMB1Q16558 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNMB1Q16558 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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KCNMB1Q16558 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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KCNMB1Q16558 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNMB1Q16558 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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