Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNXAQ16473 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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