Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDSNQ15517 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDSNQ15517 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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