Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD3Q15059 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD3Q15059 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
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