Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERC3Q15034 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERC3Q15034 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
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