Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EXOSC7Q15024 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC7Q15024 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC7Q15024 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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