Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NFIXQ14938 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NFIXQ14938 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFIXQ14938 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms