Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PUM1Q14671 ODF2-209ENST00000434106 3890 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.182e-6■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 ODF2-220ENST00000604420 3030 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.232e-6■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.422e-6■■■□□ 16.1
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PUM1Q14671 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.656e-7■■■□□ 16.1
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PUM1Q14671 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.396e-7■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.266e-7■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 MBD4-205ENST00000505883 613 ntTSL 316.68■□□□□ 0.266e-7■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.26e-7■■■□□ 16.1
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PUM1Q14671 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.456e-7■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 CPNE7-205ENST00000529800 519 ntTSL 512.15□□□□□ -0.466e-7■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.486e-7■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 BAZ2A-210ENST00000549787 2773 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.516e-7■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.526e-7■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 MSH6-204ENST00000445503 4158 ntTSL 1 (best)11.23□□□□□ -0.616e-7■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.666e-7■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 RFC1-203ENST00000418436 1255 ntTSL 1 (best)10.56□□□□□ -0.726e-7■■■□□ 16.1
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PUM1Q14671 RFC1-213ENST00000512275 841 ntTSL 36.9□□□□□ -1.36e-7■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.316e-7■■■□□ 16.1
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PUM1Q14671 RFC1-208ENST00000504849 873 ntTSL 35.94□□□□□ -1.466e-7■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.516e-7■■■□□ 16.1
PUM1Q14671 PLA2G12A-203ENST00000502772 245 ntTSL 52.61□□□□□ -1.996e-7■■■□□ 16.1
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PUM1Q14671 FLNA-211ENST00000465144 398 ntTSL 216.96■□□□□ 0.315e-13■■■□□ 16
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PUM1Q14671 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.263e-6■■■□□ 15.9
PUM1Q14671 UBE2Q2-207ENST00000567921 478 ntTSL 35.18□□□□□ -1.583e-6■■■□□ 15.9
PUM1Q14671 UBE2Q2-202ENST00000426727 2158 ntTSL 1 (best)5.14□□□□□ -1.593e-6■■■□□ 15.9
PUM1Q14671 SEC31A-230ENST00000510167 857 ntTSL 49.89□□□□□ -0.837e-9■■■□□ 15.9
PUM1Q14671 SEC31A-234ENST00000512664 710 ntTSL 36.43□□□□□ -1.387e-9■■■□□ 15.9
PUM1Q14671 SEC31A-224ENST00000507828 1329 ntTSL 55.57□□□□□ -1.527e-9■■■□□ 15.9
PUM1Q14671 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.647e-9■■■□□ 15.9
PUM1Q14671 IK-211ENST00000610522 737 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.669e-10■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.81e-6■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.31e-6■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.521e-6■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.072e-6■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.092e-6■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 ST13-204ENST00000455824 798 ntTSL 516.84■□□□□ 0.291e-8■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 ST13-205ENST00000480048 592 ntTSL 411.87□□□□□ -0.511e-8■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 SEPT5-205ENST00000412544 1108 ntTSL 517.16■□□□□ 0.341e-6■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 SLBP-203ENST00000480936 558 ntTSL 425.23■■□□□ 1.634e-10■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.14e-10■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.374e-10■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.194e-10■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.556e-7■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.66e-7■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.656e-7■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 MYH10-202ENST00000360416 7762 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.771e-7■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 MYH10-201ENST00000269243 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.891e-7■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.891e-7■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 DDX6-203ENST00000529162 1795 ntTSL 211.49□□□□□ -0.571e-17■■■□□ 15.8
PUM1Q14671 PRPF8-212ENST00000575116 460 ntTSL 311.15□□□□□ -0.623e-8■■■□□ 15.8
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