Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCN5AQ14524 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN5AQ14524 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN5AQ14524 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
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