Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL9A3Q14050 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL9A3Q14050 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL9A3Q14050 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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