Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL4A6Q14031 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A6Q14031 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A6Q14031 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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