Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPSQ13938 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPSQ13938 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPSQ13938 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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