Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBA3CQ13748 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA3CQ13748 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3CQ13748 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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