Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SEMA3FQ13275 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3FQ13275 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
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