Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MRPL28Q13084 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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