Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC16Q13042 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC16Q13042 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC16Q13042 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms