Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.614e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 MED15-227ENST00000486656 577 ntTSL 418.56■□□□□ 0.564e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 MED15-205ENST00000414658 717 ntTSL 318.56■□□□□ 0.564e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 PDCD6IP-217ENST00000498147 802 ntTSL 318.51■□□□□ 0.554e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 AKR7A2-202ENST00000330072 1171 ntTSL 218.45■□□□□ 0.544e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 PDCD6IP-203ENST00000413073 566 ntTSL 418.22■□□□□ 0.514e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 DCAF8-207ENST00000447377 728 ntTSL 217.87■□□□□ 0.454e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.354e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.334e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 MED15-214ENST00000441501 840 ntTSL 316.86■□□□□ 0.294e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 PDCD6IP-204ENST00000430877 582 ntTSL 316.13■□□□□ 0.174e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 PDCD6IP-205ENST00000435909 587 ntTSL 516.01■□□□□ 0.154e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 DCAF8-208ENST00000461888 2277 ntTSL 515.92■□□□□ 0.144e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 UGGT1-202ENST00000376723 6682 ntTSL 1 (best)15.49■□□□□ 0.074e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.034e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 KIZ-205ENST00000611685 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.8□□□□□ -0.044e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 PDCD6IP-210ENST00000477798 587 ntTSL 414.5□□□□□ -0.094e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.274e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.34e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.334e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 MED15-213ENST00000438962 573 ntTSL 413.01□□□□□ -0.334e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 JPT1-204ENST00000465454 509 ntTSL 412.78□□□□□ -0.364e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.384e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.394e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.44e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.464e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 AKR7A2-203ENST00000481966 488 ntTSL 312.12□□□□□ -0.474e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 FBXO18-207ENST00000469009 886 ntTSL 511.99□□□□□ -0.494e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 DCAF8-205ENST00000419626 439 ntTSL 211.94□□□□□ -0.54e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.514e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 PDCD6IP-206ENST00000457054 5962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.544e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 GDI2-209ENST00000609712 622 ntTSL 311.68□□□□□ -0.544e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 UGGT1-205ENST00000438277 3113 ntTSL 1 (best)11.64□□□□□ -0.554e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 USP14-202ENST00000383589 2168 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.584e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 GDI2-204ENST00000418688 636 ntTSL 511.34□□□□□ -0.594e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RNF213-207ENST00000559070 4644 ntTSL 1 (best)11.21□□□□□ -0.624e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 USP14-203ENST00000400266 1681 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.654e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-214ENST00000452025 779 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.684e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 KIZ-210ENST00000619189 2130 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.74e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 DCAF8-204ENST00000407642 517 ntTSL 210.51□□□□□ -0.734e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 DCAF8-202ENST00000368073 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.774e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 DCAF8-216ENST00000495887 919 ntTSL 310.11□□□□□ -0.794e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 USP14-205ENST00000578942 3189 ntTSL 29.96□□□□□ -0.824e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-202ENST00000359429 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.824e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-206ENST00000429921 2511 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.884e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 AL139011.2-202ENST00000485079 914 ntTSL 39.38□□□□□ -0.914e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 ATXN1-202ENST00000436367 10587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.934e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-212ENST00000441588 496 ntTSL 49.12□□□□□ -0.954e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-210ENST00000438204 796 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.954e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-213ENST00000445268 668 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.954e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-209ENST00000438191 426 ntTSL 59.06□□□□□ -0.964e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.974e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.974e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.994e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 SMARCC1-208ENST00000492896 568 ntTSL 48.77□□□□□ -1.014e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-201ENST00000354506 3165 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.014e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-207ENST00000435437 858 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.024e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 KIZ-204ENST00000451772 536 ntTSL 38.56□□□□□ -1.044e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 JPT1-212ENST00000584079 382 ntTSL 58.54□□□□□ -1.044e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 GDI2-208ENST00000608581 634 ntTSL 38.5□□□□□ -1.054e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-216ENST00000454822 2130 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.074e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 GDI2-201ENST00000380127 584 ntTSL 38.26□□□□□ -1.094e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.094e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-203ENST00000408981 737 ntTSL 58.23□□□□□ -1.094e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 DCAF8-203ENST00000368074 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.14e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-204ENST00000411934 792 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.14e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-211ENST00000438265 668 ntTSL 38.15□□□□□ -1.14e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 C6orf89-202ENST00000359359 2565 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.134e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.144e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.164e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 KIZ-207ENST00000616679 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.3□□□□□ -1.244e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 DCAF8-206ENST00000440682 501 ntTSL 37.3□□□□□ -1.244e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 GFPT1-204ENST00000494201 625 ntTSL 56.97□□□□□ -1.294e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.294e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.314e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RPE-215ENST00000453724 546 ntTSL 56.16□□□□□ -1.424e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.442e-6■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.484e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 KIZ-214ENST00000621366 1397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)4.19□□□□□ -1.744e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 KIZ-201ENST00000419359 517 ntTSL 23.64□□□□□ -1.834e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 KIZ-209ENST00000619179 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 53.33□□□□□ -1.884e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 USP14-209ENST00000583119 578 ntTSL 52.81□□□□□ -1.964e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.014e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.734e-13■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 QSER1-203ENST00000527250 448 ntTSL 32.66□□□□□ -1.984e-13■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.282e-6■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 EXOC4-204ENST00000460346 762 ntTSL 49.53□□□□□ -0.881e-11■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.051e-11■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 EXOC4-216ENST00000482089 628 ntTSL 46.66□□□□□ -1.341e-11■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 EXOC4-221ENST00000489931 578 ntTSL 46.66□□□□□ -1.341e-11■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 EXOC4-209ENST00000469115 755 ntTSL 36.66□□□□□ -1.341e-11■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 EXOC4-217ENST00000483800 559 ntTSL 46.66□□□□□ -1.341e-11■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 EXOC4-212ENST00000479839 543 ntTSL 44.92□□□□□ -1.621e-11■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 RBM6-207ENST00000434592 2342 ntTSL 26.38□□□□□ -1.396e-10■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 HAPLN3-205ENST00000563808 807 ntTSL 217.4■□□□□ 0.384e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.324e-7■■■■□ 24.8
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 96.3 ms