Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ELP6Q0PNE2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELP6Q0PNE2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELP6Q0PNE2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms