Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PUDPQ08623 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PUDPQ08623 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PUDPQ08623 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PUDPQ08623 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms