Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF4Q08170 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SRSF4Q08170 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRSF4Q08170 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms