Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ATP7AQ04656 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ATP7AQ04656 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ATP7AQ04656 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms