Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRB3Q04118 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PRB3Q04118 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRB3Q04118 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRB3Q04118 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRB3Q04118 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRB3Q04118 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PRB3Q04118 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRB3Q04118 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRB3Q04118 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PRB3Q04118 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRB3Q04118 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRB3Q04118 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRB3Q04118 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRB3Q04118 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms