Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ID3Q02535 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ID3Q02535 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ID3Q02535 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ID3Q02535 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ID3Q02535 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ID3Q02535 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ID3Q02535 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ID3Q02535 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ID3Q02535 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ID3Q02535 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ID3Q02535 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ID3Q02535 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ID3Q02535 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ID3Q02535 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ID3Q02535 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ID3Q02535 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ID3Q02535 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ID3Q02535 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ID3Q02535 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ID3Q02535 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ID3Q02535 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ID3Q02535 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ID3Q02535 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ID3Q02535 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ID3Q02535 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ID3Q02535 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ID3Q02535 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ID3Q02535 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ID3Q02535 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ID3Q02535 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ID3Q02535 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ID3Q02535 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ID3Q02535 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ID3Q02535 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ID3Q02535 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ID3Q02535 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ID3Q02535 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ID3Q02535 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ID3Q02535 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ID3Q02535 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ID3Q02535 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ID3Q02535 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ID3Q02535 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ID3Q02535 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ID3Q02535 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ID3Q02535 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ID3Q02535 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ID3Q02535 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ID3Q02535 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ID3Q02535 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ID3Q02535 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ID3Q02535 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ID3Q02535 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ID3Q02535 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ID3Q02535 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ID3Q02535 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ID3Q02535 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ID3Q02535 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ID3Q02535 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ID3Q02535 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ID3Q02535 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ID3Q02535 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ID3Q02535 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ID3Q02535 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ID3Q02535 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ID3Q02535 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ID3Q02535 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms