Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SATB1Q01826 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SATB1Q01826 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SATB1Q01826 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms