Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED6P86452 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED6P86452 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms