Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCALDP61601 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCALDP61601 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCALDP61601 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCALDP61601 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCALDP61601 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCALDP61601 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCALDP61601 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCALDP61601 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCALDP61601 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCALDP61601 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCALDP61601 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCALDP61601 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCALDP61601 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCALDP61601 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCALDP61601 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCALDP61601 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCALDP61601 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCALDP61601 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCALDP61601 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCALDP61601 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCALDP61601 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCALDP61601 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCALDP61601 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCALDP61601 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCALDP61601 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCALDP61601 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCALDP61601 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCALDP61601 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCALDP61601 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCALDP61601 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCALDP61601 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCALDP61601 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCALDP61601 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCALDP61601 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCALDP61601 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCALDP61601 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCALDP61601 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCALDP61601 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCALDP61601 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCALDP61601 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCALDP61601 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCALDP61601 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCALDP61601 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCALDP61601 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCALDP61601 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCALDP61601 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCALDP61601 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCALDP61601 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCALDP61601 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCALDP61601 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCALDP61601 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCALDP61601 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCALDP61601 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCALDP61601 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCALDP61601 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCALDP61601 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCALDP61601 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCALDP61601 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCALDP61601 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCALDP61601 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NCALDP61601 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCALDP61601 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCALDP61601 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCALDP61601 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCALDP61601 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCALDP61601 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCALDP61601 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCALDP61601 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCALDP61601 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCALDP61601 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCALDP61601 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCALDP61601 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCALDP61601 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCALDP61601 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCALDP61601 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCALDP61601 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCALDP61601 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCALDP61601 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCALDP61601 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCALDP61601 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCALDP61601 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCALDP61601 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCALDP61601 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCALDP61601 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCALDP61601 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCALDP61601 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCALDP61601 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCALDP61601 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCALDP61601 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCALDP61601 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCALDP61601 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCALDP61601 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCALDP61601 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCALDP61601 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCALDP61601 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCALDP61601 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCALDP61601 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCALDP61601 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCALDP61601 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms