Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBE2D3P61077 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms